MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Helicobacter pylori XZ274 plasmid pXZ274

Total Repeats: 515

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017919	TTC	2	6	49	54	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017919	CAGGCT	2	12	135	146	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017919	TAAA	2	8	174	181	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017919	TTG	2	6	193	198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017919	TAA	2	6	234	239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017919	TTA	2	6	269	274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017919	A	6	6	375	380	100 %	0 %	0 %	0 %	387908782
8	NC_017919	TGA	2	6	395	400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387908782
9	NC_017919	CAA	2	6	522	527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387908782
10	NC_017919	GAT	2	6	528	533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387908782
11	NC_017919	CAAGTT	2	12	543	554	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387908782
12	NC_017919	ACT	2	6	622	627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387908782
13	NC_017919	A	6	6	630	635	100 %	0 %	0 %	0 %	387908782
14	NC_017919	ATT	2	6	707	712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387908782
15	NC_017919	GGT	2	6	764	769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387908782
16	NC_017919	ATC	2	6	771	776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387908782
17	NC_017919	TGA	2	6	785	790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387908782
18	NC_017919	GAA	3	9	804	812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387908782
19	NC_017919	A	6	6	885	890	100 %	0 %	0 %	0 %	387908782
20	NC_017919	AAG	2	6	907	912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387908782
21	NC_017919	TAA	2	6	913	918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387908782
22	NC_017919	TAA	2	6	966	971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387908783
23	NC_017919	TTAC	2	8	980	987	25 %	50 %	0 %	25 %	387908783
24	NC_017919	A	6	6	991	996	100 %	0 %	0 %	0 %	387908783
25	NC_017919	GAAA	2	8	1044	1051	75 %	0 %	25 %	0 %	387908783
26	NC_017919	A	6	6	1090	1095	100 %	0 %	0 %	0 %	387908783
27	NC_017919	A	6	6	1111	1116	100 %	0 %	0 %	0 %	387908783
28	NC_017919	AATTT	2	10	1121	1130	40 %	60 %	0 %	0 %	387908783
29	NC_017919	T	6	6	1198	1203	0 %	100 %	0 %	0 %	387908783
30	NC_017919	A	7	7	1212	1218	100 %	0 %	0 %	0 %	387908783
31	NC_017919	AAAAG	2	10	1244	1253	80 %	0 %	20 %	0 %	387908783
32	NC_017919	TA	3	6	1273	1278	50 %	50 %	0 %	0 %	387908783
33	NC_017919	ATT	2	6	1319	1324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387908783
34	NC_017919	TGA	2	6	1446	1451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387908783
35	NC_017919	AG	3	6	1482	1487	50 %	0 %	50 %	0 %	387908783
36	NC_017919	ATA	2	6	1490	1495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387908783
37	NC_017919	A	7	7	1618	1624	100 %	0 %	0 %	0 %	387908783
38	NC_017919	TAA	2	6	1662	1667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387908783
39	NC_017919	A	6	6	1706	1711	100 %	0 %	0 %	0 %	387908783
40	NC_017919	T	6	6	1731	1736	0 %	100 %	0 %	0 %	387908783
41	NC_017919	CT	3	6	1752	1757	0 %	50 %	0 %	50 %	387908783
42	NC_017919	AG	3	6	1785	1790	50 %	0 %	50 %	0 %	387908783
43	NC_017919	TAA	2	6	1896	1901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387908783
44	NC_017919	TAGA	2	8	2024	2031	50 %	25 %	25 %	0 %	387908783
45	NC_017919	GCT	2	6	2041	2046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387908783
46	NC_017919	TAG	2	6	2066	2071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387908783
47	NC_017919	AAT	2	6	2131	2136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387908783
48	NC_017919	ACA	2	6	2169	2174	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387908783
49	NC_017919	GTA	2	6	2227	2232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017919	A	6	6	2277	2282	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017919	CCT	2	6	2357	2362	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387908784
52	NC_017919	GAT	2	6	2417	2422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387908784
53	NC_017919	AAG	2	6	2478	2483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387908784
54	NC_017919	A	6	6	2505	2510	100 %	0 %	0 %	0 %	387908784
55	NC_017919	AGA	2	6	2539	2544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387908784
56	NC_017919	CCAA	2	8	2559	2566	50 %	0 %	0 %	50 %	387908784
57	NC_017919	A	6	6	2585	2590	100 %	0 %	0 %	0 %	387908784
58	NC_017919	TGG	2	6	2596	2601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387908784
59	NC_017919	AAT	2	6	2656	2661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017919	T	6	6	2715	2720	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017919	ACC	2	6	2736	2741	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_017919	TAA	2	6	2744	2749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017919	ATA	2	6	2783	2788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017919	TA	3	6	2828	2833	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017919	GAT	2	6	2888	2893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387908785
66	NC_017919	AGG	2	6	2915	2920	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387908785
67	NC_017919	ATT	2	6	2960	2965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387908785
68	NC_017919	AAGA	2	8	2973	2980	75 %	0 %	25 %	0 %	387908785
69	NC_017919	TAA	2	6	3026	3031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387908785
70	NC_017919	GAT	2	6	3107	3112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387908785
71	NC_017919	AAAG	2	8	3159	3166	75 %	0 %	25 %	0 %	387908785
72	NC_017919	GCTAT	2	10	3174	3183	20 %	40 %	20 %	20 %	387908785
73	NC_017919	CAC	2	6	3206	3211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387908785
74	NC_017919	GCCAA	2	10	3212	3221	40 %	0 %	20 %	40 %	387908785
75	NC_017919	TGAA	2	8	3277	3284	50 %	25 %	25 %	0 %	387908785
76	NC_017919	TGA	2	6	3304	3309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387908785
77	NC_017919	CTA	2	6	3319	3324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387908785
78	NC_017919	A	6	6	3342	3347	100 %	0 %	0 %	0 %	387908785
79	NC_017919	ATA	2	6	3403	3408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387908785
80	NC_017919	AGTG	2	8	3440	3447	25 %	25 %	50 %	0 %	387908785
81	NC_017919	ATG	2	6	3508	3513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387908785
82	NC_017919	A	6	6	3537	3542	100 %	0 %	0 %	0 %	387908785
83	NC_017919	AAC	2	6	3598	3603	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017919	A	6	6	3640	3645	100 %	0 %	0 %	0 %	387908786
85	NC_017919	CAA	2	6	3684	3689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387908786
86	NC_017919	AAAC	3	12	3695	3706	75 %	0 %	0 %	25 %	387908786
87	NC_017919	AGA	2	6	3714	3719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387908786
88	NC_017919	A	6	6	3724	3729	100 %	0 %	0 %	0 %	387908786
89	NC_017919	TGA	2	6	3758	3763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387908786
90	NC_017919	AGA	2	6	3771	3776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387908786
91	NC_017919	TGAA	2	8	3782	3789	50 %	25 %	25 %	0 %	387908786
92	NC_017919	AAG	2	6	3827	3832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387908786
93	NC_017919	T	6	6	3839	3844	0 %	100 %	0 %	0 %	387908786
94	NC_017919	A	6	6	3859	3864	100 %	0 %	0 %	0 %	387908786
95	NC_017919	A	7	7	3941	3947	100 %	0 %	0 %	0 %	387908787
96	NC_017919	AAC	2	6	4061	4066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387908787
97	NC_017919	A	6	6	4106	4111	100 %	0 %	0 %	0 %	387908787
98	NC_017919	AAG	2	6	4143	4148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387908787
99	NC_017919	CAT	2	6	4273	4278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387908787
100	NC_017919	CGT	2	6	4292	4297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387908787
101	NC_017919	GCT	2	6	4302	4307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387908787
102	NC_017919	AT	3	6	4426	4431	50 %	50 %	0 %	0 %	387908787
103	NC_017919	A	6	6	4448	4453	100 %	0 %	0 %	0 %	387908787
104	NC_017919	AAG	2	6	4503	4508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387908787
105	NC_017919	AAG	2	6	4584	4589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387908787
106	NC_017919	TA	3	6	4631	4636	50 %	50 %	0 %	0 %	387908787
107	NC_017919	A	6	6	4646	4651	100 %	0 %	0 %	0 %	387908787
108	NC_017919	GAAA	2	8	4693	4700	75 %	0 %	25 %	0 %	387908787
109	NC_017919	AAAGC	2	10	4729	4738	60 %	0 %	20 %	20 %	387908787
110	NC_017919	AAG	2	6	4797	4802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387908787
111	NC_017919	A	6	6	4850	4855	100 %	0 %	0 %	0 %	387908787
112	NC_017919	GAA	2	6	4856	4861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387908787
113	NC_017919	AGA	2	6	4993	4998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387908787
114	NC_017919	GA	3	6	5038	5043	50 %	0 %	50 %	0 %	387908787
115	NC_017919	AGA	2	6	5071	5076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387908787
116	NC_017919	A	6	6	5084	5089	100 %	0 %	0 %	0 %	387908787
117	NC_017919	ATGG	2	8	5116	5123	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017919	TGG	2	6	5191	5196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387908788
119	NC_017919	TAA	2	6	5294	5299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387908788
120	NC_017919	TTCT	2	8	5318	5325	0 %	75 %	0 %	25 %	387908788
121	NC_017919	A	6	6	5328	5333	100 %	0 %	0 %	0 %	387908788
122	NC_017919	CTT	2	6	5474	5479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387908788
123	NC_017919	TTGT	2	8	5540	5547	0 %	75 %	25 %	0 %	387908788
124	NC_017919	TAA	2	6	5549	5554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387908788
125	NC_017919	ATC	2	6	5585	5590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387908788
126	NC_017919	TTTCA	2	10	5597	5606	20 %	60 %	0 %	20 %	387908788
127	NC_017919	A	6	6	5642	5647	100 %	0 %	0 %	0 %	387908788
128	NC_017919	A	6	6	5711	5716	100 %	0 %	0 %	0 %	387908788
129	NC_017919	T	6	6	5770	5775	0 %	100 %	0 %	0 %	387908788
130	NC_017919	T	7	7	5849	5855	0 %	100 %	0 %	0 %	387908788
131	NC_017919	TTC	2	6	5891	5896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387908788
132	NC_017919	TG	3	6	5949	5954	0 %	50 %	50 %	0 %	387908788
133	NC_017919	GGT	2	6	5969	5974	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387908788
134	NC_017919	TTA	2	6	5989	5994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387908788
135	NC_017919	T	7	7	6025	6031	0 %	100 %	0 %	0 %	387908788
136	NC_017919	TTTA	2	8	6059	6066	25 %	75 %	0 %	0 %	387908788
137	NC_017919	GTT	2	6	6085	6090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387908788
138	NC_017919	TTTTTC	2	12	6125	6136	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	387908788
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140	NC_017919	TAA	2	6	6152	6157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387908788
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